Meteorologické prvky ako teplota vzduchu, relatívna vlhkosť vzduchu, globálna radiácia alebo zrážky ovplyvňujú zloženie, štruktúru, rast, zdravotný stav a dynamiku lesných ekosystémov. Aby sme mohli tieto prvky použiť pri vyhodnocovaní rôznych monitorovacích aktivít na plochách intenzívneho monitoringu (II. úrovne), je nevyhnutné zabezpečiť meranie ich rozsahu a zmeny v čase čo najpresnejšie.

Meteorologické merania v sieti meteorologických staníc SHMÚ v mnohých prípadoch nedostatočne reprezentujú lesné oblasti. Je to spôsobené priestorovou heterogenitou územia (nadmorskou výškou, expozíciou, sklonom terénu, špecifickou orografiou), ktorá výrazne ovplyvňuje prúdenie vzduchu, čo sa prejavuje časovou aj priestorovou heterogenitou priebehu meteorologických prvkov.

Z tohto dôvodu sa v blízkosti monitorovacích plôch II. úrovne sleduje priebeh počasia pomocou automatických meteorologických staníc s kontinuálnym priebehom merania.

Tieto dáta sa využívajú pri hodnotení atmosférickej depozície v lesnom prostredí ako aj pri sledovaní cyklu jednotlivých prvkov a vody, a tiež pri hodnotení životných prejavov stromov.

Hlavnými cieľmi meteorologického monitoringu je

• opísanie meteorologických podmienok a ich zmien na monitorovacích plochách II. úrovne
• skúmanie meteorologických podmienok pre vytváranie hypotéz vysvetľujúcich vzťah počasia k stavu lesného ekosystému
• identifikovanie a skúmanie stresových faktorov pre stromy, predovšetkým extrémov počasia ako silný mráz, dlhotrvajúce sucho, horúčavy
• vytvorenie dlhých časových radov pre potreby neskorších analýz reakcie ekosystému na meniace sa podmienky prostredia (vodnú bilanciu a dostupnosť,  cyklus prvkov...)

Automatické meteorologické stanice sú umiestnené v bezprostrednom okolí monitorovacích plôch II. úrovne na voľnej nezalesnenej ploche alebo na monitorovacej veži nad porastom. Sledujú a zaznamenávajú sa na nich nasledovné meteorologické prvky (meteo-stanica na voľnej ploche):

• teplota vzduchu vo výške 2 metre
• relatívna vlhkosť vzduchu vo výške 2 metre
• zrážky vo výške 1,5 metra
• rýchlosť a smer vetra vo výške 10 metrov
• globálne žiarenie vo výške 10 metrov

Náčrt meteorologickej stanice s kontinuálnym meraním a GSM prenosom dát: 1–teplota a relatívna vlhkosť vzduchu (2 m), 2 – rýchlosť vetra (10 m), 3 – smer vetra (10 m), 4 – globálne žiarenie (10 m), 5 – zrážky (1,5 m),  6 – dataloger s modemom, 7 – solárny panel.